Xã Văn Phương được hình thành với nhiều tên gọi khác nhau. Thời Bắc thuộc, vùng đất Văn Phương ngày nay thuộc huyện Võ Công, quận Cửu Chân. Thời Trần, thuộc trấn Thiên Quan, năm Tự Đức thứ 15 thuộc phủ Thiên Quan. Cuối thế kỷ thứ XIX, các thôn nhất xã, nhất thôn gồm có xã Chi phương (nay là thôn Tiền Phương 1; thôn Tiền Phương 2) thuộc tổng Văn Luận; xã Bất Cô (Bồng lai) thuộc tổng Tam Đồng thôn Sọng, thôn Xuân Viên được sáp nhập thành xã Minh Đức.
        Đến tháng 4 năm 1949, thực hiện chủ trương của Đảng và Chính phủ về việc hợp nhất các xã nhỏ thành liên xã lớn, các xã Minh Đức, Cúc Phương, Yên Quang sáp nhập thành lập xã Quang Trung, thôn Rồng, thôn Sui chuyển từ xã Văn Phong về xã Văn Phú. Đến tháng 11 năm 1953, xã Quang Trung tách ra thành lập 3 xã: Cúc Phương, Yên Quang, Quang Trung, Ba thôn Rồng, Sui, Bến chia tách từ xã Văn Phú sáp nhập về xã Quang Trung. Đến năm 1964, tại kỳ họp lần thứ 5 của Hội đồng nhân dân tỉnh Ninh Bình (khóa III) diễn ra từ ngày 30/3 đến 2/4/1964 đã quyết nghị đổi tên 9 xã của huyện Nho Quan và 17 xã của huyện Kim Sơn, theo quyết nghị, xã Quang Trung huyện Nho Quan đổi tên thành xã Văn Phương. Theo Quyết định số 199-NV, ngày 22/7/1964 của Bộ Nội vụ về việc đổi tên một số xã trong tỉnh, xã Quang Trung được đổi tên thành xã Văn Phương. Năm 1978, thực hiện sự chỉ đạo của Huyện Uỷ, Ủy ban nhân dân huyện cắt toàn bộ diện tích của nhân dân thôn Sọng để thành lập Nông trường Phùng Thượng, nhân dân thôn Sọng phải chuyển ra sinh sống ở các thôn Tiền Phương 1, Tiền Phương 2, Xuân Viên và Bồng lai.

         Xã Văn Phương ngày nay gồm có 7 thôn: Tiền Phương1; Tiền Phương 2; Xuân Viên; Bồng Lai; Bến; Sui và Rồng. Diện tích tự nhiên của xã có 879,5ha. Trong đó, đất nông nghiệp 445ha.